学院成立于1953年5月,前身为座落于乌市西北路国营新疆运输公司驾训队
1954年定名为国营新疆运输公司驾训大队,校址乌市黄河路。
1956年迁至昌吉州吉木萨尔县三台镇。
1958年学校定名为国营新疆运输公司工人训练队,迁址在乌市老满城。
1960年定名为新疆交通厅汽车驾驶学校,校址乌市八户梁,1962年,学校撤销。
1964年,创办交通局驾训大队,校址米泉县十三户。
1968年,文化大革命期间停办。
1974年,学校恢复,更名为新疆交通技工学校。
1982年,创办新疆交通学校。
1985年,新疆交通技工学校与新疆交通学校分校独立办学,1997年,两校又重新合并。
2004年,升格为新疆交通职业技术学院。